La Universidad Jatun Yachay Wasu, tiene como misión aplicar la tecnología, en los saberes ancestrales y el conocimiento a partir del pleno ejercicio de la ciencia ancestral de los aborígenes, en la organización social, en la medicina, en la agropecuaria, en la construcción, las artes y en la gastronomía andina.

Su visión se basa en construirse como ente de la humanidad en la recreación y fortalecimiento de la sabiduría y formación de profesionales capaces de aplicar la ciencia y la tecnología para el desarrollo de la vida y la cultura.

Jatun Yachay Wasi se desarrolla en el área agrícola, área de salud, área de arquitectura  y área social. Cada una de estas carreras responde a las necesidades relacionadas con el desarrollo personal y social de quienes optan por este tipo de estudio.

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